247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2985 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2985  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 424 aa  830    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 441 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  31.95 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  31.64 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  29.76 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  29.76 
 
 		 427 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  27.86 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  28.89 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  29.26 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  29.26 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  25.7 
 
 		 443 aa  127  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  25.47 
 
 		 443 aa  126  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  28.47 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  26.53 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  27.55 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  28.02 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  27.76 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  29.05 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  28.77 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  26.8 
 
 		 451 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  26.76 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  24.36 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  29.41 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.36 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  28.65 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  28.66 
 
 		 366 aa  99.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 445 aa  97.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  27.51 
 
 		 384 aa  96.7  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  28.72 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  25.47 
 
 		 446 aa  93.6  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  26.3 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  25.47 
 
 		 446 aa  93.6  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  26.08 
 
 		 428 aa  89.7  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  23.53 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  25.81 
 
 		 428 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  23.53 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  24.69 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  24.93 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  25.98 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  24.69 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  25.22 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  24.36 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  25.22 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  23.33 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  25.18 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  24.75 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  23.28 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0846  hypothetical protein  23.96 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000055342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0838  hypothetical protein  22.38 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.0062417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0779  permease, putative  24.72 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.759724  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0230  hypothetical protein  25.91 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0317148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3900  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  28.32 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0251  major facilitator family transporter  22.34 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.823307  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  26.04 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  23.28 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  30.5 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3837  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3978  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 438 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 458 aa  53.1  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 427 aa  53.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>