More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2905 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  100 
 
 		 430 aa  832    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  52.32 
 
 		 411 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  39.67 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  34.08 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 439 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  36.29 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  37.16 
 
 		 460 aa  196  9e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  38.52 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 437 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 423 aa  186  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 447 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  32.98 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 430 aa  155  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  25.46 
 
 		 443 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  26.33 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 441 aa  117  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 415 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  28 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  26.01 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  26.27 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  32.68 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  32.68 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 425 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  28.01 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  31.23 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  26.95 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.72 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  26.72 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  25.89 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  26.16 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 446 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 446 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  26.27 
 
 		 446 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 417 aa  96.3  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  26.28 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  26.28 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  27.14 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  28.99 
 
 		 452 aa  93.6  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  28.99 
 
 		 452 aa  93.6  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  26.86 
 
 		 428 aa  93.2  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  29.1 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  29.1 
 
 		 432 aa  91.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  25.94 
 
 		 426 aa  90.1  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  27.73 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  30.09 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  23.45 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  30.09 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  25 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  23.45 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  24.8 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  27.72 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.23 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  24.52 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  22.59 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  27.23 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  22.22 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  26.81 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  30.95 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  26.89 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>