More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2392 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
416 aa  795    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  41.92 
 
 
431 aa  278  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  42.19 
 
 
439 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  42.19 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  42.19 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  40.89 
 
 
439 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  41.41 
 
 
439 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  41.67 
 
 
439 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  35.66 
 
 
436 aa  242  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  38.9 
 
 
437 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  39.8 
 
 
440 aa  239  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  37.19 
 
 
450 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 
439 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  34.01 
 
 
452 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  32.13 
 
 
427 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 
449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  32.74 
 
 
453 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  32.74 
 
 
453 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 
453 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  32.74 
 
 
453 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  32.74 
 
 
453 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
449 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  32.11 
 
 
436 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  32.74 
 
 
453 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  32.74 
 
 
453 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  32.74 
 
 
453 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  31.46 
 
 
436 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  31.55 
 
 
438 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 
431 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  31.05 
 
 
449 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  30.9 
 
 
447 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  30.9 
 
 
447 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  31.21 
 
 
447 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  31.21 
 
 
447 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  30.72 
 
 
450 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  30.9 
 
 
447 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  30.98 
 
 
447 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  32.38 
 
 
444 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  30.14 
 
 
455 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.92 
 
 
448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  30.48 
 
 
449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.56 
 
 
456 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  33.17 
 
 
436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.68 
 
 
448 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
458 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  29.1 
 
 
453 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  31.06 
 
 
450 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
419 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  29.67 
 
 
429 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  29.93 
 
 
430 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  29.53 
 
 
485 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  29.6 
 
 
445 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  29.93 
 
 
430 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  29.6 
 
 
445 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  29.19 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  30.16 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  30.86 
 
 
410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  29.19 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 
443 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.71 
 
 
446 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  31.04 
 
 
448 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  31.04 
 
 
448 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.04 
 
 
448 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  31.04 
 
 
448 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  28.47 
 
 
446 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  31.04 
 
 
448 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  31.04 
 
 
448 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  31.04 
 
 
448 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  29.7 
 
 
430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  28.76 
 
 
485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  29.6 
 
 
467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  28.81 
 
 
432 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  30.13 
 
 
435 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  29.71 
 
 
458 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  28.57 
 
 
432 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  28.57 
 
 
432 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  28.54 
 
 
454 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  28.54 
 
 
454 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  29.2 
 
 
451 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  29.44 
 
 
455 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  28.29 
 
 
454 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  29.45 
 
 
459 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  27.11 
 
 
468 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  27.09 
 
 
430 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  28.34 
 
 
430 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  29.95 
 
 
428 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
453 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  28.43 
 
 
454 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  27.25 
 
 
449 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.498164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  25.45 
 
 
444 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  25.45 
 
 
444 aa  155  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  25.45 
 
 
444 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  25.45 
 
 
444 aa  155  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  25.45 
 
 
444 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  25.45 
 
 
444 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  25.45 
 
 
444 aa  155  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  25.45 
 
 
444 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  27.94 
 
 
464 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>