More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2673 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  86.85 
 
 
403 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  100 
 
 
403 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  86.85 
 
 
406 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  86.85 
 
 
406 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  86.1 
 
 
406 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  86.95 
 
 
383 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  63.76 
 
 
401 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  50.26 
 
 
445 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4416  major facilitator transporter  54.99 
 
 
408 aa  326  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 
404 aa  305  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  50.92 
 
 
400 aa  273  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2421  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 
400 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.107516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  25.54 
 
 
382 aa  86.3  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25 
 
 
439 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.76 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.43 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 
449 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  24.03 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  29.81 
 
 
448 aa  67  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.14 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.14 
 
 
439 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  23.08 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  23.54 
 
 
423 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  23.54 
 
 
423 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
399 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  26.98 
 
 
429 aa  63.2  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  21.62 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.88 
 
 
450 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  27.61 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  24.22 
 
 
430 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  23.48 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 
396 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  23.48 
 
 
404 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  23.4 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  22.51 
 
 
430 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  24.14 
 
 
429 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  24.56 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  24.56 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  24.56 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  25.26 
 
 
420 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  23.55 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  23.9 
 
 
430 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  24.12 
 
 
428 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  21.57 
 
 
383 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  24.56 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
443 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  26.01 
 
 
440 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  24.14 
 
 
440 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  24.6 
 
 
410 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  26.37 
 
 
437 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  23.71 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 
440 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  24.92 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.65 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  23.95 
 
 
425 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  22.04 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  23.99 
 
 
453 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 
453 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  23.99 
 
 
453 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  24.12 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  24.12 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  23.99 
 
 
453 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  25.1 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
479 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  23.99 
 
 
453 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  23.99 
 
 
453 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 
435 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  28.73 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  23.99 
 
 
453 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  23.99 
 
 
453 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  22.77 
 
 
411 aa  53.9  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  24.08 
 
 
406 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  24.27 
 
 
406 aa  53.1  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0419  major facilitator transporter  25.61 
 
 
396 aa  53.5  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  27.84 
 
 
410 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  23.5 
 
 
407 aa  53.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  24.52 
 
 
420 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  25.66 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  24.19 
 
 
443 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  23.72 
 
 
383 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  25 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  25.88 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  23.66 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  23.53 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  24.31 
 
 
446 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>