More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2594 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  100 
 
 
395 aa  773    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  51.23 
 
 
388 aa  338  9e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 
382 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 
380 aa  240  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  30.52 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  30.38 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  30.38 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  30.38 
 
 
417 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  30.38 
 
 
417 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  30.38 
 
 
416 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  30.38 
 
 
417 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  30.38 
 
 
416 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  32.24 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
408 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  29.44 
 
 
403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  29.75 
 
 
396 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  30.2 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  29.76 
 
 
403 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  29.98 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  31.12 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  26.21 
 
 
403 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  31.2 
 
 
412 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  28.99 
 
 
403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  26.79 
 
 
412 aa  116  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  31.58 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  31.58 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  31.44 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  30.38 
 
 
403 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  27.81 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  30.95 
 
 
398 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  30.57 
 
 
410 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
400 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  26.15 
 
 
403 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  26.15 
 
 
403 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
418 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  26.15 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  26.15 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  32.54 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  32.03 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  30.1 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  25.88 
 
 
403 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  25.88 
 
 
403 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  25.88 
 
 
403 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  26.15 
 
 
403 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  25.88 
 
 
403 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  28.22 
 
 
404 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  31.54 
 
 
412 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
408 aa  109  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 
401 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  30.03 
 
 
397 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  29.9 
 
 
406 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  30.52 
 
 
403 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  26.8 
 
 
382 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  25.2 
 
 
402 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  28.46 
 
 
401 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  30 
 
 
406 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  27.64 
 
 
421 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  28.06 
 
 
410 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  31.09 
 
 
412 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  28.86 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  28.86 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  28.86 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  30.92 
 
 
422 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  28.86 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  28.57 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  29.55 
 
 
421 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  28.1 
 
 
403 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  26.46 
 
 
389 aa  103  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  28.89 
 
 
423 aa  103  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  29.25 
 
 
411 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  29.15 
 
 
406 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  28.61 
 
 
406 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 
406 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 
406 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 
406 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  28.61 
 
 
406 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  29.22 
 
 
406 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  28.92 
 
 
404 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  28.92 
 
 
404 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  29.69 
 
 
409 aa  99.8  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  29.5 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  30 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2162  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  28.57 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  28.57 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  26.65 
 
 
410 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  28.57 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  29.73 
 
 
420 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  27.93 
 
 
431 aa  97.1  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>