137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2522 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  84.03 
 
 
420 aa  704    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
440 aa  866    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  63.57 
 
 
420 aa  488  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  51.33 
 
 
423 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
427 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 
423 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  46.76 
 
 
428 aa  344  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  45.54 
 
 
399 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  27.19 
 
 
429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  24.3 
 
 
393 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  24.56 
 
 
393 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  32.93 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  33.73 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  30.82 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  28.42 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  24.74 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  25.74 
 
 
422 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  31.4 
 
 
440 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  25.56 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  28.07 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
396 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  26.07 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 
449 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
396 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 
390 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  28.31 
 
 
420 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  30.2 
 
 
420 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 
390 aa  60.5  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  29.07 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  31.29 
 
 
421 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  30.06 
 
 
411 aa  56.6  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  33.88 
 
 
417 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  24.24 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  32.33 
 
 
405 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 
419 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
394 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  28.27 
 
 
403 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 
486 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 
486 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 
486 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 
486 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 
486 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 
486 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 
401 aa  52.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  29.25 
 
 
529 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 
414 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  22.45 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  31.33 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  25.69 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27.23 
 
 
440 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  24.42 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  25.39 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 
513 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  25.13 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.74 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  25.45 
 
 
406 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  25.45 
 
 
406 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  29.41 
 
 
415 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  21.65 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.04 
 
 
443 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
415 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
415 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 
390 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
390 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  31.37 
 
 
604 aa  46.6  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2601  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
456 aa  46.6  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000137946  hitchhiker  0.0011303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
437 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  22.33 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  25.51 
 
 
440 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  26.71 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  34.86 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  23.97 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 
471 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  21.03 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.93 
 
 
473 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.93 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  27.59 
 
 
513 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  28.85 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  23.04 
 
 
448 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.93 
 
 
474 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  25 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  27.36 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.2 
 
 
449 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  29.93 
 
 
476 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  24.34 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
503 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 
524 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0694  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.794303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 
433 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 
429 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
408 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.7 
 
 
511 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>