More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0619 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  791    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  44.07 
 
 		 411 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  34.96 
 
 		 408 aa  222  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  32.57 
 
 		 414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  32.14 
 
 		 402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  32.57 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  32.57 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  32.41 
 
 		 404 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 408 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  32.58 
 
 		 404 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  32.4 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  31.97 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  31.2 
 
 		 409 aa  199  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  32.31 
 
 		 415 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  32.48 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 407 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  29.75 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  27.79 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  29.23 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  36.57 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  23.64 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  22.59 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  27.98 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  25.28 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  24.64 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.71 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  27.73 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  21.64 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  27.75 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  28.03 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.81 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  24.54 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  24.54 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  28.03 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  29.19 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  28.03 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.66 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>