231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1916 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  791    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 412 aa  791    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  99.76 
 
 		 412 aa  789    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  70.17 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  69.48 
 
 		 403 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  57.44 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  52.2 
 
 		 396 aa  333  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  47.96 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  54.02 
 
 		 397 aa  308  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  46.53 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  50.96 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  47.15 
 
 		 411 aa  249  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  46.28 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  41.96 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 424 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  30.07 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  23.34 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  22.47 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  22.47 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  22.47 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  21.95 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  22.19 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  21.45 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  30.13 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  20.79 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  20.89 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  29.52 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.52 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  21.72 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  33.68 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  21.09 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  20.75 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  18.98 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  24.11 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 439 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.19 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.4 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  25.59 
 
 		 448 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  25 
 
 		 429 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 430 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.79 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  21.46 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  23.95 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.37 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  21.46 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  25.88 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  25 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  21.46 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4009  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.636189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 437 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  30 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 421 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0436  regulatory protein UhpC  22.99 
 
 		 434 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 398 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  32.02 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  21.82 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.93 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  23.85 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>