45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6429 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 373 aa  756    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  29.18 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  29.83 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  27.97 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  26.53 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0964  unsaturated glucuronyl hydrolase  27.57 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.361732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  26.79 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  29.85 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  28.42 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  26.46 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  28.11 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  24.55 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  26.67 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  28.53 
 
 		 364 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  27.56 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  27.83 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  24.93 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  28.79 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  27.81 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  27.98 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  24.61 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  27.53 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  26.43 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  26.92 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3480  Arabinose efflux permease-like protein  30.3 
 
 		 738 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0787182  hitchhiker  0.00623555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  24.49 
 
 		 399 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  25.43 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  24.23 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  25.3 
 
 		 414 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  23.86 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  25.53 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  22.87 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  24.7 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  23.65 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  29.15 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  23.64 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  28.86 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  27.75 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  27.17 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  22.36 
 
 		 469 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  31.41 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  25.46 
 
 		 420 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  23.53 
 
 		 460 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  25.39 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  26.78 
 
 		 489 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>