45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5334 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  92.82 
 
 		 390 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  82.31 
 
 		 390 aa  674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 390 aa  812    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  54.09 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  55.15 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  49.87 
 
 		 391 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  45.88 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  45.36 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  45.69 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  44.3 
 
 		 394 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  43.44 
 
 		 395 aa  322  9.000000000000001e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  41.07 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  40.21 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  38.28 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  38.72 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  36.72 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  36.05 
 
 		 440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  36.64 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  37.09 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  35.65 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  34.95 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  33.93 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  33.42 
 
 		 403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  33.85 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  32.55 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  31.92 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  33.53 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  33.94 
 
 		 393 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  32.59 
 
 		 405 aa  170  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  33.51 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  32.04 
 
 		 400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  31.8 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  30.65 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  28.68 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  27.61 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  27.25 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 		 522 aa  116  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  29.85 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  24.32 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  24.11 
 
 		 493 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  29.61 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  29.32 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  25.19 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0964  unsaturated glucuronyl hydrolase  22.52 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.361732  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  31.4 
 
 		 179 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>