44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2694 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 383 aa  802    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  63.32 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  56.72 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  52.8 
 
 		 440 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  54.07 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  50.39 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  56.32 
 
 		 405 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  52.96 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  55.05 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  52.62 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  52.51 
 
 		 392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  46.82 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  51.16 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  47.18 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  48.58 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  50.43 
 
 		 402 aa  332  7.000000000000001e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  49.36 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  45.74 
 
 		 404 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  40.9 
 
 		 401 aa  249  8e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  39.81 
 
 		 364 aa  222  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  36.75 
 
 		 390 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  35.98 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  36.64 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  34.76 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  35.14 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  36.53 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  34.95 
 
 		 391 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  32.8 
 
 		 396 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  33.43 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  35.69 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  34.46 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  34.34 
 
 		 398 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  33.24 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  34.49 
 
 		 522 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  30.45 
 
 		 391 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  31.32 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  28.57 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  26.11 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  23.96 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  24.09 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  24.56 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  23.58 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  24.1 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 		 179 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>