44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2238 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 403 aa  834    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  61.42 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  61.01 
 
 		 440 aa  492  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  58.58 
 
 		 414 aa  491  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  54.52 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  52.35 
 
 		 393 aa  411  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  52.64 
 
 		 420 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  55.26 
 
 		 405 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  54.07 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  53.95 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  48.46 
 
 		 423 aa  358  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  49.6 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  50.85 
 
 		 392 aa  339  7e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  48.41 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  45.86 
 
 		 402 aa  319  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  45 
 
 		 396 aa  312  6.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  49.57 
 
 		 400 aa  308  9e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  40.73 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  38.44 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  33.42 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  32.9 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  34.55 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  31.81 
 
 		 391 aa  186  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  34.33 
 
 		 384 aa  186  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  37.81 
 
 		 364 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  34.62 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  33.14 
 
 		 394 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  33.04 
 
 		 391 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  31.9 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  31.56 
 
 		 396 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  31.2 
 
 		 396 aa  162  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  30.21 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  31.69 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  30.59 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  31.04 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  29.35 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  29.34 
 
 		 522 aa  142  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  24.13 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  24.07 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  26.76 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  21.12 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  29.15 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  39.33 
 
 		 179 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  22.25 
 
 		 469 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>