41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3789 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  1006    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  94.88 
 
 
493 aa  956    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  38.27 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  31.23 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  31.23 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  29.53 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  29.49 
 
 
398 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  29.49 
 
 
391 aa  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  30.12 
 
 
394 aa  106  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  28.2 
 
 
400 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  28.3 
 
 
391 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  24.21 
 
 
423 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  25.64 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  30.3 
 
 
391 aa  97.1  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  27.73 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  22.13 
 
 
401 aa  87  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  24.34 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  24.54 
 
 
399 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  25.9 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  25.41 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  22.46 
 
 
489 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  27.38 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  24.47 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  24.32 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  30.29 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  24.07 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  26.96 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  24.68 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  25 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  24.09 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  24.01 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  26.16 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  28.57 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  27.06 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  24.71 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  23.56 
 
 
522 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  23.53 
 
 
395 aa  63.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  22.6 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  24.19 
 
 
388 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  27.67 
 
 
469 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  27.17 
 
 
373 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>