43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1901 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  100 
 
 
398 aa  832    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  64.05 
 
 
396 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  64.3 
 
 
396 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  49.87 
 
 
394 aa  375  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  49.23 
 
 
391 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  48.03 
 
 
384 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  46.72 
 
 
391 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  45.95 
 
 
390 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  45.69 
 
 
390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  45.93 
 
 
390 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  45.43 
 
 
395 aa  336  5.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  43.92 
 
 
388 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  44.15 
 
 
391 aa  333  4e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  35.19 
 
 
400 aa  253  5.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  33.51 
 
 
364 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  34.44 
 
 
392 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  33.97 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  34.69 
 
 
440 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  31.79 
 
 
401 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  34.34 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  31.5 
 
 
396 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  32.06 
 
 
400 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  31.9 
 
 
403 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  35.26 
 
 
399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  33.63 
 
 
400 aa  166  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  31.48 
 
 
397 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  32.56 
 
 
414 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  31.47 
 
 
420 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  32.92 
 
 
393 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  34.02 
 
 
405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  29.52 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  31.73 
 
 
395 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  29.69 
 
 
402 aa  152  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  33.13 
 
 
404 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  29.2 
 
 
404 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  27.99 
 
 
489 aa  113  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  29.49 
 
 
488 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  29.15 
 
 
493 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
522 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  24.61 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  23 
 
 
469 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  21.41 
 
 
460 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  21.95 
 
 
459 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>