43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0400 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  100 
 
 		 396 aa  822    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  98.23 
 
 		 396 aa  808    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  64.05 
 
 		 398 aa  548  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  51.71 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  51.77 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  46.39 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  46.28 
 
 		 391 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  45.88 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  47.06 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  45.36 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  47 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  45.14 
 
 		 390 aa  362  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  46.58 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  37.12 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  35.79 
 
 		 364 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  32.8 
 
 		 383 aa  192  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  33.51 
 
 		 392 aa  186  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  32.83 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  35.28 
 
 		 412 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  30.37 
 
 		 401 aa  173  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  32.86 
 
 		 397 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  31.64 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  32.43 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  30.47 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  31.56 
 
 		 403 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  33.43 
 
 		 395 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  30.33 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  29.87 
 
 		 414 aa  156  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  28.16 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  29.92 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  30.29 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  31.03 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  31.4 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  34 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  30.56 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  31.23 
 
 		 493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  31.23 
 
 		 488 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  25.8 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  25.87 
 
 		 489 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 		 522 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  28.02 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  27.75 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  23.15 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>