44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3864 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 400 aa  835    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  61.46 
 
 		 440 aa  508  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  61.42 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  57.75 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  51.02 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  55.47 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  53.42 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  54.1 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  55.05 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  51.59 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  45.61 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  44.95 
 
 		 423 aa  336  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  48.15 
 
 		 397 aa  332  6e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  40.56 
 
 		 396 aa  315  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  46.42 
 
 		 400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  51.09 
 
 		 402 aa  306  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  46.33 
 
 		 404 aa  293  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  46.29 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  37.64 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  32.63 
 
 		 391 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  33.62 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  32.11 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  32.55 
 
 		 391 aa  176  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  32.06 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  32.23 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  32.04 
 
 		 390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  31.14 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  31.74 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  30.95 
 
 		 394 aa  159  9e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  32.23 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  31.03 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  31.43 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  29.79 
 
 		 395 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  31.21 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  29.05 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  32.81 
 
 		 489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  30.29 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  30.29 
 
 		 488 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  25.53 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  22.16 
 
 		 469 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  23.75 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  37.78 
 
 		 179 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  21.37 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>