44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0790 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 423 aa  880    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  51.33 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  49.88 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  49.16 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  46.68 
 
 		 440 aa  359  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  48.46 
 
 		 403 aa  358  7e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  46.82 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  51.85 
 
 		 405 aa  354  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  46.67 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  47.24 
 
 		 392 aa  346  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  45.99 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  46.04 
 
 		 400 aa  338  9e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  44.95 
 
 		 400 aa  336  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  43.22 
 
 		 396 aa  331  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  43.78 
 
 		 414 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  44.86 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  42.05 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  42.71 
 
 		 412 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  37.57 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  34.77 
 
 		 364 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  31.92 
 
 		 390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  31.89 
 
 		 391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  31.51 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  31.36 
 
 		 390 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  30.89 
 
 		 391 aa  172  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  30.31 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  32.05 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  29.07 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  27.99 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  29.52 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  28.16 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  29.27 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  27.91 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  30.32 
 
 		 489 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  28.18 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  26.63 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  24.21 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  24.21 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  23.89 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  24.09 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  24.2 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  22.9 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 179 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>