45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3029 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 391 aa  822    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  58.06 
 
 		 391 aa  496  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  55.15 
 
 		 390 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  55.67 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  54.09 
 
 		 390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  53.03 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  48.99 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  49.23 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  47 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  47.26 
 
 		 396 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  46.52 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  45 
 
 		 395 aa  338  7e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  43.54 
 
 		 391 aa  315  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  40.89 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  37.98 
 
 		 364 aa  239  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  37.91 
 
 		 392 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  35.98 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  37.46 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  33.73 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  33.14 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  33.07 
 
 		 399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  33.03 
 
 		 396 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  32.63 
 
 		 400 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  31.81 
 
 		 403 aa  186  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  33.91 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  34.29 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  31.76 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  30.89 
 
 		 423 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  33.33 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  31.14 
 
 		 401 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  33.13 
 
 		 402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  31.89 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  30.72 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  30.15 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  28.07 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  27.97 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  26.77 
 
 		 489 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  28.11 
 
 		 522 aa  99.8  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  28.72 
 
 		 493 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  30.3 
 
 		 488 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  26.8 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  22.41 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  29.63 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0964  unsaturated glucuronyl hydrolase  20.25 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.361732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>