44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7344 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  82.56 
 
 		 390 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  100 
 
 		 390 aa  814    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  82.31 
 
 		 390 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  54.17 
 
 		 384 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  53.03 
 
 		 391 aa  433  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  49.6 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  45.14 
 
 		 396 aa  362  8e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  44.62 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  45.93 
 
 		 398 aa  354  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  45.08 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  42.49 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  38.97 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  40.97 
 
 		 391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  39.53 
 
 		 400 aa  255  8e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  39.35 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  34.92 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  33.98 
 
 		 440 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  37.13 
 
 		 392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  36.53 
 
 		 383 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  34.55 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  33.92 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  33.24 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  32.74 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  34.78 
 
 		 420 aa  179  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  35.91 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  33.83 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  30.31 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  31.85 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  31.74 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  31.75 
 
 		 404 aa  159  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  30.64 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  31.5 
 
 		 402 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  31.35 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  31.82 
 
 		 393 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  28.14 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  27.44 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 		 522 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  27.56 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  27.38 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  26.91 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  29.47 
 
 		 469 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  27.36 
 
 		 460 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  26.84 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  29.89 
 
 		 179 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>