44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6823 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 399 aa  835    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  54.52 
 
 		 440 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  54.52 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  51.02 
 
 		 400 aa  425  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  51.99 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  56.72 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  54.43 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  53.2 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  55.86 
 
 		 395 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  53.99 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  49.49 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  51.26 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  46.67 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  54.78 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  50.5 
 
 		 400 aa  358  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  42.11 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  49.23 
 
 		 404 aa  307  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  45.32 
 
 		 412 aa  295  8e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  40.26 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  37.22 
 
 		 364 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  32.99 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  33.07 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  32.55 
 
 		 390 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  33.06 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  33.33 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  34.33 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  33.59 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  32.35 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  31.64 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  35.03 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  33.64 
 
 		 394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  32.15 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  32.44 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  31.92 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  30.56 
 
 		 489 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  28.83 
 
 		 522 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  28.21 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  23.77 
 
 		 493 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  24.68 
 
 		 488 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  24.49 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  23.16 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  23.1 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  22.88 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  35.16 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>