42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2883 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 459 aa  940    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  60.3 
 
 		 469 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  58.54 
 
 		 460 aa  565  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  27.47 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  26.02 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  23.4 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  23.2 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  29.56 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  22.69 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  24.09 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  25.25 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  23.26 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  29.9 
 
 		 390 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  32.35 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  23.36 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  24.09 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  29.38 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  28.64 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  27.63 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  22.99 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  25.3 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  26.79 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  23.75 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  23.16 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  25.31 
 
 		 405 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  20.8 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  26.94 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  30.68 
 
 		 522 aa  53.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  28.21 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  28.21 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  22.84 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  23.62 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  22.28 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  27.98 
 
 		 493 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  20.1 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  24.31 
 
 		 404 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  26.8 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  24.21 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  23.1 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  28.05 
 
 		 488 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  25.52 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  25 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>