43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1855 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 404 aa  831    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  32.69 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  30.29 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  30.87 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  28.2 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  28.01 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  30.13 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  29.35 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  29.46 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  28.57 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  30.12 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  30.63 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  29.2 
 
 		 398 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  30.56 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  28.76 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  28.53 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  26.63 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  28.12 
 
 		 395 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  29.79 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  31.58 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  26.95 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  28.4 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  28.14 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  26.89 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  28.27 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  29.38 
 
 		 388 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  27.53 
 
 		 400 aa  129  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  29.33 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  28.57 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  28.21 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  27.89 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  28.62 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  27.25 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  27.53 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  27.25 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  27.82 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  26.85 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  25.68 
 
 		 522 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  25 
 
 		 493 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  28.79 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  24.34 
 
 		 488 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  25.47 
 
 		 460 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  25.43 
 
 		 469 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>