44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4196 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 
396 aa  828    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  50.39 
 
 
383 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  47.29 
 
 
397 aa  336  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  43.22 
 
 
423 aa  331  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  48.31 
 
 
395 aa  325  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  47.84 
 
 
440 aa  323  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  44.33 
 
 
392 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  40.56 
 
 
400 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  46.5 
 
 
393 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  45 
 
 
403 aa  312  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  42.11 
 
 
399 aa  309  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  41.73 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  45.48 
 
 
412 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  45.38 
 
 
405 aa  296  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  45.06 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  42.23 
 
 
420 aa  282  9e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  39.5 
 
 
404 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  40.66 
 
 
402 aa  276  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  38.41 
 
 
401 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  38.2 
 
 
364 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  33.93 
 
 
390 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  33.93 
 
 
390 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  33.03 
 
 
391 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  32.74 
 
 
390 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  32.83 
 
 
396 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  32.83 
 
 
396 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  33.23 
 
 
391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  31.5 
 
 
398 aa  177  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  33.13 
 
 
394 aa  176  7e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  33.64 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  30.65 
 
 
391 aa  173  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  32.21 
 
 
395 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  31.37 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  30.33 
 
 
400 aa  156  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  28.27 
 
 
489 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  29.65 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  26.95 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  26.47 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  23.67 
 
 
493 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  24.47 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  25.36 
 
 
460 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
179 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  21.57 
 
 
459 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  22.36 
 
 
469 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>