45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5051 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  92.82 
 
 		 390 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  82.56 
 
 		 390 aa  679    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 390 aa  812    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  55.15 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  55.41 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  50.13 
 
 		 391 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  46.39 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  45.88 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  45.95 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  45.08 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  44.62 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  42.02 
 
 		 388 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  40 
 
 		 391 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  39.48 
 
 		 400 aa  250  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  38.92 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  36.72 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  36.75 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  33.71 
 
 		 440 aa  202  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  35.07 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  34.37 
 
 		 397 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  35.93 
 
 		 392 aa  192  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  33.93 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  32.9 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  32.62 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  32.98 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  31.36 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  32.45 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  33.64 
 
 		 393 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  33.23 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  32.55 
 
 		 401 aa  166  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  31.8 
 
 		 402 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  32.34 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  31.14 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  31.04 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  28.76 
 
 		 489 aa  129  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  30.5 
 
 		 522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  27.89 
 
 		 404 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  28.42 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  25.07 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  25.41 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  29.84 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  29.35 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  28.99 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  31.4 
 
 		 179 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0964  unsaturated glucuronyl hydrolase  21.78 
 
 		 382 aa  46.2  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.361732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>