37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4761 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  70.84 
 
 		 469 aa  692    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 460 aa  957    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  58.54 
 
 		 459 aa  553  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  25.47 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  24.09 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  22.84 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  25.93 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  22.96 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  23.64 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  24.56 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  27.03 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  22.89 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  23.33 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  25 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  23.27 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  22.41 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  29.35 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  29.61 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  21.12 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  25.36 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  21.41 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  23.51 
 
 		 397 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  27.36 
 
 		 390 aa  53.5  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  28 
 
 		 522 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  22.88 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  23.8 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  22.98 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  21.54 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  22.93 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  26.09 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  21.37 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  23.15 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  23.15 
 
 		 396 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  22.63 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  23.15 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  24.1 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  25.23 
 
 		 493 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>