44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0776 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 364 aa  754    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  37.98 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  39.35 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  38.92 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  38.72 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  38.21 
 
 		 394 aa  226  7e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  39.81 
 
 		 383 aa  222  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  35.75 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  38.96 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  36.53 
 
 		 440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  38.2 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  35.79 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  38.07 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  37.22 
 
 		 399 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  36.24 
 
 		 396 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  38.63 
 
 		 412 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  35.48 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  35.95 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  34.77 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  33.79 
 
 		 388 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  33.79 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  33.51 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  36.09 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  37.81 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  34.85 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  33.62 
 
 		 400 aa  182  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  32.7 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  36.34 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  35.08 
 
 		 401 aa  179  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  36.14 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  33.51 
 
 		 420 aa  172  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  33.53 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  33.85 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  32.93 
 
 		 402 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  32.69 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  27.04 
 
 		 489 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  30.08 
 
 		 522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  27.73 
 
 		 488 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  27.73 
 
 		 493 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  28.38 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  27.03 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  27.66 
 
 		 469 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  29.26 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 		 179 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>