44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3963 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 395 aa  823    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  67.19 
 
 		 393 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  51.33 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  55.86 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  53.6 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  53.95 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  52.96 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  45.61 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  52.79 
 
 		 405 aa  355  7.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  49.21 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  46.42 
 
 		 414 aa  354  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  53.1 
 
 		 402 aa  346  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  49.63 
 
 		 400 aa  342  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  48.31 
 
 		 396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  48.54 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  45.91 
 
 		 392 aa  313  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  47.18 
 
 		 412 aa  312  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  42.68 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  38.4 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  36.14 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  34.94 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  32.55 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  30.65 
 
 		 390 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  32.43 
 
 		 390 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  33.43 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  31.94 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  32.76 
 
 		 400 aa  169  9e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  31.2 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  31.35 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  31.47 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  31.52 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  30.72 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  29.15 
 
 		 489 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  31.73 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  30.03 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  28.12 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 		 522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  26.43 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  24.94 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  24.87 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  26.17 
 
 		 459 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  23.83 
 
 		 469 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  29.35 
 
 		 179 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  23.81 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>