44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3866 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 420 aa  876    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  51.44 
 
 		 403 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  50.24 
 
 		 414 aa  428  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  51.92 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  52.54 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  49.88 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  48.67 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  50.49 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  48.58 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  46.08 
 
 		 392 aa  346  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  48.17 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  48.93 
 
 		 395 aa  325  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  44.59 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  45.04 
 
 		 397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  45.97 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  42.23 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  42.26 
 
 		 412 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  42.15 
 
 		 404 aa  279  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  35.18 
 
 		 401 aa  229  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  35.65 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  35.07 
 
 		 390 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  33.91 
 
 		 391 aa  192  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  34.78 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  33.51 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  33.72 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  33.72 
 
 		 384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  31.9 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  33.24 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  32.87 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  30.33 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  30.08 
 
 		 396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  29.23 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  30.32 
 
 		 400 aa  159  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  30.77 
 
 		 391 aa  154  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  30.43 
 
 		 489 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  30.22 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  28.57 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  24.13 
 
 		 493 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  24.01 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  26.4 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  23.62 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  23.8 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  27 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  36.59 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>