More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1704 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  100 
 
 
426 aa  835    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  58.17 
 
 
410 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  57.56 
 
 
416 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  60.25 
 
 
405 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  57.63 
 
 
416 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  58.27 
 
 
414 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  62.27 
 
 
393 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  52.23 
 
 
398 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  58.29 
 
 
404 aa  355  6.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  51.71 
 
 
411 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  51.71 
 
 
411 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  51.94 
 
 
409 aa  350  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  60.16 
 
 
402 aa  349  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  51.44 
 
 
411 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  53.13 
 
 
411 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  50.86 
 
 
422 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  54.27 
 
 
408 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  51.48 
 
 
402 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  50 
 
 
401 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  49.87 
 
 
401 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  49.19 
 
 
401 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 
428 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  52.86 
 
 
411 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  48.01 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  51.04 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  45.76 
 
 
394 aa  318  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  49.87 
 
 
419 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 
406 aa  317  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  47.45 
 
 
406 aa  315  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  46.75 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  46.75 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  46.75 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  52 
 
 
411 aa  313  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  53.92 
 
 
443 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  54.57 
 
 
406 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  54.59 
 
 
406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  45.97 
 
 
394 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  45.97 
 
 
394 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  45.97 
 
 
394 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  45.97 
 
 
394 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
394 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  47.57 
 
 
399 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  41.62 
 
 
399 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  41.37 
 
 
399 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  46.32 
 
 
394 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  46.32 
 
 
394 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  46.32 
 
 
394 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  42.04 
 
 
385 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  41.79 
 
 
399 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  46.6 
 
 
394 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  46.32 
 
 
394 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  46.05 
 
 
394 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.41 
 
 
399 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 
399 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
399 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  40.7 
 
 
411 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 
352 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  50.92 
 
 
403 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
407 aa  259  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  40.77 
 
 
404 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  41.09 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 
409 aa  252  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  50.54 
 
 
400 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  47.06 
 
 
329 aa  249  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 
413 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  40.31 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  40.31 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  40.31 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  40.31 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  40.31 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  40.31 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  40.31 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  40 
 
 
389 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  40 
 
 
389 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  39.43 
 
 
404 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  43.26 
 
 
395 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  41.36 
 
 
400 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  37.5 
 
 
393 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  43.4 
 
 
397 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  41.22 
 
 
398 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  33.42 
 
 
394 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  43.31 
 
 
395 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  38.85 
 
 
421 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  39.95 
 
 
383 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  39.45 
 
 
399 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  38.13 
 
 
395 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  37.66 
 
 
403 aa  224  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  38.52 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  38.4 
 
 
415 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  38.54 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 
413 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  38.71 
 
 
405 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1850  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 
395 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  39.95 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  40.83 
 
 
389 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  40.56 
 
 
429 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  37.81 
 
 
405 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  37.81 
 
 
405 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>