235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1797 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1797  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  791    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  23.97 
 
 		 448 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.93 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  25.25 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.25 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  24.53 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  25.25 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  25.25 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  25.25 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  25.25 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  25.25 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  22.75 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 428 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  23.97 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  21.48 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  21.72 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  21.73 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  21.39 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  22.4 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  20.4 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  22.4 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  22.4 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  22.43 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  25 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  22.83 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  23.87 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  21.81 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 454 aa  56.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  20.11 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  20.63 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  21.96 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  26.55 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  20.11 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  20.11 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  21.32 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  20.77 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  20.05 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  20.11 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  22.83 
 
 		 454 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  22.83 
 
 		 454 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  19.41 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  22.61 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  19.68 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  19.68 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  19.68 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  21.47 
 
 		 438 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  20 
 
 		 460 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  21.22 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  22.9 
 
 		 464 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  22.92 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  19.41 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  21.41 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  20.89 
 
 		 468 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  21.09 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  21.57 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>