73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4528 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4528  major facilitator transporter  100 
 
 		 392 aa  751    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 398 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  27.82 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  24.54 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0235  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0393  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.464327  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  21.82 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  21.04 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  30.77 
 
 		 472 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  27.98 
 
 		 443 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  33.33 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  33.33 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  33.33 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  33.33 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  33.33 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  33.33 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.87 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.87 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  32.64 
 
 		 472 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  28.04 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  20.73 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 474 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  31.94 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  31.94 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  31.94 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  31.94 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  31.94 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  28.33 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4596  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  30.71 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280784  hitchhiker  0.00129913 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5633  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  30.71 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  decreased coverage  0.00133804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5226  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  30.71 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0158809  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  29.3 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 473 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  26.35 
 
 		 459 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  23.76 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  27.17 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08080  arabinose efflux permease family protein  28.96 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  29.11 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  24 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  26.32 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 456 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1033  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0053  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  30.14 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0040  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 394 aa  42.7  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 431 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>