157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2826 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
380 aa  708    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 
415 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  39.41 
 
 
398 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  40.36 
 
 
391 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  40.62 
 
 
394 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  41.71 
 
 
408 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  41.05 
 
 
416 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  40.83 
 
 
416 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  41.64 
 
 
411 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  39.94 
 
 
415 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  40.84 
 
 
388 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  39.79 
 
 
443 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  40.37 
 
 
395 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  41.9 
 
 
416 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
395 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  40.77 
 
 
415 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  42.67 
 
 
393 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  39.55 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1033  major facilitator transporter  39.11 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2373  MFS family transporter  39.11 
 
 
389 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.098036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  26.12 
 
 
398 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  29.73 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  28.96 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  29.27 
 
 
397 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  26.47 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  31.2 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  29.2 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  29.15 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  30.14 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  24.05 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  27.93 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  28.53 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  31.37 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  32.73 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  29.74 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  30.11 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4528  major facilitator transporter  30.19 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  32.49 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33770  hypothetical protein  29.78 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.756882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  29.43 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  28.57 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  26.74 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  29.24 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  24.14 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  24.86 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  25.47 
 
 
388 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  29.95 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  29.79 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  25.61 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  25.82 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  30.08 
 
 
428 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  27.59 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  27.59 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  26.74 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  27.59 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  28.41 
 
 
413 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  30.03 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  29.27 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  31.23 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  29.87 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  32.13 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  27.64 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  31.34 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  27.03 
 
 
392 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  28.42 
 
 
386 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2647  major facilitator transporter  28.69 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.652327  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  28.85 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  25.65 
 
 
392 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  25.7 
 
 
394 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2754  hypothetical protein  29.5 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
413 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  22.39 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46180  hypothetical protein  30.35 
 
 
397 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0113792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  23.58 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  30.77 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  26.09 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  29.96 
 
 
409 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  26.64 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  26.64 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  29.4 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  30.77 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  26.64 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  24.59 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7927  major facilitator transporter  30.83 
 
 
409 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437479  normal  0.239391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0634  protein of unknown function DUF1228  29.92 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  25.8 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  30.88 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  22.96 
 
 
433 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5732  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
401 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.495479  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  34.25 
 
 
406 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45070  hypothetical protein  31.84 
 
 
401 aa  52.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  26.45 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  26.3 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>