146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4896 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  786    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  61.84 
 
 		 389 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 403 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 394 aa  209  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  32.97 
 
 		 400 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  30.08 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  27.97 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  28.17 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  27.85 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  28.45 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  28.16 
 
 		 394 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  28.01 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  27.03 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  25.84 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  27.99 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  28.28 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  27.87 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  27.22 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  27.86 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  27.42 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  27 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  27 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  27 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  27.48 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  27.75 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  27.35 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  27.94 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  28.07 
 
 		 421 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 392 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2647  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.652327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  25.38 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  29.2 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  25.84 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  29.2 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  29.2 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  26.99 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  25.46 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  25.87 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  28.91 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  29.2 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  25.13 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0330  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.422618  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0929  hypothetical protein  28.04 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0697566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1411  hypothetical protein  28.04 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  27.03 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1389  hypothetical protein  28.07 
 
 		 420 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1651  hypothetical protein  26.49 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0231704  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  28.25 
 
 		 359 aa  98.6  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  24.74 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0634  protein of unknown function DUF1228  27.91 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  26.72 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2745  protein of unknown function DUF1228  26.01 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0319  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 402 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0621236  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 398 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  24.72 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  26.27 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  26.27 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2754  hypothetical protein  24.93 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  25.21 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  24.49 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0308  hypothetical protein  34.93 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  24.64 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  24.33 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  26.2 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1313  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 504 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45070  hypothetical protein  26.78 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  25 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  26.37 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  24 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  24.07 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1904  hypothetical protein  33.09 
 
 		 437 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1384  hypothetical protein  24.07 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0951204  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46180  hypothetical protein  23.55 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0113792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  25.35 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3928  hypothetical protein  23.84 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  23.75 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1818  hypothetical protein  32.03 
 
 		 525 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1639  major facilitator superfamily permease  32.03 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1662  major facilitator superfamily permease  32.03 
 
 		 546 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252981  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0707  hypothetical protein  32.03 
 
 		 238 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>