152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0445 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  791    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  89.93 
 
 		 411 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  67.84 
 
 		 413 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  66.41 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  54.17 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  59.53 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  54.09 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33770  hypothetical protein  58.77 
 
 		 408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.756882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 406 aa  223  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  26.78 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  30.12 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  29.41 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  27.89 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  27.41 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  25.14 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  24.58 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  28.94 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  29.62 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  24.18 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  28.41 
 
 		 392 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  28.41 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  28.41 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  28.41 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  28.41 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  31.58 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  27.25 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  30.48 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  26.89 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  26.72 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  26.36 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  29.87 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  29.18 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  30.89 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  30.89 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  30.89 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  23.64 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  28.76 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  28.8 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  30.46 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  29.73 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  25.24 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  29.33 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  30.06 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  28.41 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  31.21 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  25 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  28.03 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  29.15 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  25.93 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  30.39 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 380 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  28.73 
 
 		 394 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  24.13 
 
 		 395 aa  53.5  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  28.08 
 
 		 443 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  29.8 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  28.76 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  27.64 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  25.52 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  26.59 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  29.14 
 
 		 421 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 390 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0040  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2754  hypothetical protein  30.83 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46180  hypothetical protein  28.49 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0113792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  29.25 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  27.65 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 443 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  29.03 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  30 
 
 		 526 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>