More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0216 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  780    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 406 aa  189  9e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 401 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 391 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  26.12 
 
 		 386 aa  112  9e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  25.13 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  26.94 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 403 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  25.82 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  25.82 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  26.45 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  26.45 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 406 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 388 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  26.45 
 
 		 406 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 406 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 410 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  25.82 
 
 		 403 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  25.82 
 
 		 403 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 403 aa  93.2  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  25.82 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  26.16 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  26.16 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  25 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  25.27 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  25.27 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  25.27 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  25.27 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  25.54 
 
 		 403 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  25.55 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  27.38 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  27.48 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  26.88 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  26.88 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  26.88 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  26.88 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  26.88 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  25.95 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  25.66 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  25.66 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  25.66 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 418 aa  86.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  25.66 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  26.59 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  26.09 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  26.59 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  25.33 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  27.57 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  27.06 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2362  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.951882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  23 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>