113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1291 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  770    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  93.83 
 
 		 413 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  86.77 
 
 		 417 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1389  hypothetical protein  83.17 
 
 		 420 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0929  hypothetical protein  84.85 
 
 		 420 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0697566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1411  hypothetical protein  84.85 
 
 		 439 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1904  hypothetical protein  85.9 
 
 		 437 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  64.85 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  68.6 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2745  protein of unknown function DUF1228  59.34 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  50.5 
 
 		 404 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  53.02 
 
 		 412 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  51.6 
 
 		 404 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  50 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  50.9 
 
 		 428 aa  292  8e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  51.02 
 
 		 409 aa  292  9e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  51.88 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  51.61 
 
 		 422 aa  289  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  53.06 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0273  hypothetical protein  50.44 
 
 		 427 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  43.95 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2659  major facilitator transporter  77.09 
 
 		 540 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1639  major facilitator superfamily permease  81.44 
 
 		 537 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1662  major facilitator superfamily permease  82.04 
 
 		 546 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1818  hypothetical protein  81.44 
 
 		 525 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1313  major facilitator transporter  76.83 
 
 		 504 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  40.43 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1425  hypothetical protein  69.68 
 
 		 238 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0453  hypothetical protein  69.68 
 
 		 238 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0707  hypothetical protein  69.68 
 
 		 238 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  34.4 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  36.27 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2754  hypothetical protein  33.87 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  36.58 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  32.36 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  36.55 
 
 		 405 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  35.71 
 
 		 386 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1384  hypothetical protein  36.51 
 
 		 390 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0951204  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  35.83 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  33.42 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  34.38 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46180  hypothetical protein  34.52 
 
 		 397 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0113792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2647  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.652327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  31.55 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  32.97 
 
 		 394 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  32.97 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  32.97 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  31.3 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  32.7 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  30.46 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  30.46 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1651  hypothetical protein  34.05 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0231704  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  30.46 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  34.75 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3928  hypothetical protein  33.88 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  32.97 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 397 aa  123  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  28.64 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  28.33 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  31.27 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  28.4 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  32.58 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  32.39 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  32.25 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  28.85 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45070  hypothetical protein  33.15 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  33.71 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  29.58 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  32.38 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  31.44 
 
 		 359 aa  89.7  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  30.45 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0634  protein of unknown function DUF1228  33.53 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  30.62 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  27.24 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  34.01 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  27.3 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>