95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33770 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_33770  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  775    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.756882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  64.78 
 
 
406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  57.22 
 
 
408 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  56.68 
 
 
411 aa  362  9e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  53.81 
 
 
395 aa  358  9e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  53.51 
 
 
413 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  53.89 
 
 
404 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  52.94 
 
 
409 aa  326  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  51.78 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  36.24 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  37.16 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  36.21 
 
 
398 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  25.52 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  27.08 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  26.23 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  29.03 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  25.18 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  25.57 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  29.71 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  29.43 
 
 
385 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
380 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  30.2 
 
 
395 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  29.72 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  27.55 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  24.92 
 
 
428 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  27.55 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  26.98 
 
 
405 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  29.92 
 
 
389 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  29.94 
 
 
383 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  29.94 
 
 
383 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  28.35 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  28.29 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  28.98 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  24.31 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  31.58 
 
 
443 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  24.76 
 
 
433 aa  57.4  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  26.44 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  28.69 
 
 
394 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  28.69 
 
 
394 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  24.03 
 
 
395 aa  56.6  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  26.55 
 
 
422 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  29.01 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  24.31 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  26.81 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  26.81 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  26.81 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  25.76 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  26.95 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  29.76 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  27.71 
 
 
394 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  27.45 
 
 
399 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  27.51 
 
 
388 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
397 aa  53.1  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  29.89 
 
 
405 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  25.9 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  25.9 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  26.26 
 
 
422 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  21.48 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  25.76 
 
 
392 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  25.31 
 
 
428 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  27.73 
 
 
359 aa  51.6  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  30.45 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  25.19 
 
 
397 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  30.45 
 
 
416 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  28.57 
 
 
428 aa  50.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  34.39 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  36.31 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  27.97 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  30.55 
 
 
415 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  27.34 
 
 
409 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  27.07 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  28.4 
 
 
400 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  27.27 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  30.87 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  24.62 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  25.79 
 
 
384 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  24.35 
 
 
417 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2754  hypothetical protein  28.06 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
417 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
417 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  28.25 
 
 
391 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2647  major facilitator transporter  26.99 
 
 
385 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.652327  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  24.94 
 
 
400 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 
530 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  28.15 
 
 
406 aa  43.5  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.81 
 
 
398 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1384  hypothetical protein  26.52 
 
 
390 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0951204  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 
430 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>