129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6744 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  771    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  73.58 
 
 		 404 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  63.95 
 
 		 395 aa  448  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  54.86 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  54.74 
 
 		 409 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  55.32 
 
 		 408 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  53.87 
 
 		 411 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  52.63 
 
 		 406 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33770  hypothetical protein  51.78 
 
 		 408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.756882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  40.92 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  29.92 
 
 		 408 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  26.55 
 
 		 402 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  30.57 
 
 		 400 aa  86.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  28.75 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  25.71 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  31.09 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  24.7 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  26.45 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  30.08 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  26.7 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  25.39 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  29.17 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  25 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  27.2 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  29.74 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  28.62 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  27.33 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  28.31 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  30.03 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  28.04 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  28 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  28 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  28 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  27.57 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  28.5 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  25.36 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  28.46 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  31.87 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  27.48 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  31.87 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  31.87 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  31.87 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  31.25 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  31.91 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  27.92 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  27.2 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  31.79 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  25.08 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  28.25 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  27.27 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2647  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.652327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  28.57 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  34.33 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  27.92 
 
 		 422 aa  53.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 415 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  37.5 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  27.89 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  27.82 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  27.15 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0929  hypothetical protein  31.52 
 
 		 420 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0697566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1411  hypothetical protein  31.52 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1662  major facilitator superfamily permease  30.43 
 
 		 546 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  32.53 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1818  hypothetical protein  30.43 
 
 		 525 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 408 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1425  hypothetical protein  30.43 
 
 		 238 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0453  hypothetical protein  30.43 
 
 		 238 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0707  hypothetical protein  30.43 
 
 		 238 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445459  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  26.2 
 
 		 421 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1313  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>