144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1909 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  100 
 
 		 406 aa  805    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  46.34 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  41.64 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 395 aa  249  7e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  35.57 
 
 		 406 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  35.73 
 
 		 409 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 411 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 408 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33770  hypothetical protein  35.83 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.756882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 398 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  27.65 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  26.1 
 
 		 395 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  25.07 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  26.25 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  25 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  28.21 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  29.26 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  25.28 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  27.92 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  28.57 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  24.72 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  31.78 
 
 		 400 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  27.05 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  26.39 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  33.78 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  21.22 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  26.36 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  26.91 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  28.27 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  24.66 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  24.85 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  32.58 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  25 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  24.62 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  27.43 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  24.93 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  23.68 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  25.75 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46180  hypothetical protein  35.1 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0113792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  24.37 
 
 		 409 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3928  hypothetical protein  35.1 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1384  hypothetical protein  27.2 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0951204  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  25.88 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  23.76 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  23.76 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  23.2 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  23.76 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  23.2 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  27.81 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  23.31 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  23.31 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  26.49 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  23.68 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  23.2 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  23.2 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  25 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  22.86 
 
 		 433 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  53.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  22.86 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  22.86 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  22.86 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  30.67 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  30.67 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3303  putative multidrug resistance protein  26.74 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  30.67 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  23.16 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  36 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  36 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  30 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09611  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.228862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  22.37 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1033  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  30 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>