More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1701 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  790    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 486 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  30.21 
 
 		 415 aa  130  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 442 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  26.94 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  26.26 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  34.46 
 
 		 434 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  30 
 
 		 425 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 427 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 457 aa  90.5  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 472 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 422 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 412 aa  87.4  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  28.69 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  28.62 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  28 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  29 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  28.4 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  30.53 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  28.78 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  23.81 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  24.32 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  28.69 
 
 		 404 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  25 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  25.18 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  25 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>