97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_2061 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  100 
 
 
417 aa  833    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  34.89 
 
 
428 aa  236  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  31.26 
 
 
422 aa  225  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1682  hypothetical protein  93.04 
 
 
123 aa  216  9e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
419 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  33.09 
 
 
448 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
440 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  96.77 
 
 
103 aa  180  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  31.9 
 
 
423 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  29.78 
 
 
428 aa  167  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  27.41 
 
 
433 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1683  hypothetical protein  96.3 
 
 
82 aa  156  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  26.6 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  26.6 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  26.6 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  26.6 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.810342 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  26.6 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
421 aa  153  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  26.37 
 
 
421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  26.37 
 
 
421 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1684  hypothetical protein  93.51 
 
 
90 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  27.62 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
438 aa  129  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  24.34 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  24.14 
 
 
425 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  24.37 
 
 
425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  24.12 
 
 
425 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  24.12 
 
 
425 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  24.12 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  24.14 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  25.67 
 
 
427 aa  113  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  24.65 
 
 
427 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  27.86 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  23.22 
 
 
497 aa  72  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  24.37 
 
 
207 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  23.56 
 
 
461 aa  62  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  20.73 
 
 
483 aa  61.6  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  24.39 
 
 
429 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  20.67 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  20.67 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  20.67 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  20.67 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  25.93 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  21.01 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  21.01 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  22.83 
 
 
404 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0646  putative regulatory protein UhpC  22.05 
 
 
459 aa  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  23.16 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  20.48 
 
 
424 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  25.38 
 
 
389 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.38 
 
 
387 aa  47  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  23.2 
 
 
398 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1043  major facilitator transporter  24.48 
 
 
440 aa  46.6  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  25.08 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  25.08 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  25.08 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  19.6 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  25.08 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  19.85 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  20 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  20.1 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  25.08 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2682  major facilitator transporter  21.84 
 
 
447 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.874415  normal  0.720259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  20.1 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  26.15 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  25.08 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44190  putative sugar MFS transporter  28.74 
 
 
462 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0069077  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3760  MFS family transporter  28.74 
 
 
447 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  23.21 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  24.77 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  25.08 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  22.8 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  25.71 
 
 
478 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2750  major facilitator transporter  21.84 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  20.54 
 
 
444 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  20 
 
 
423 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  20 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  23.56 
 
 
436 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  20.54 
 
 
444 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
442 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  20.7 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
434 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  20.9 
 
 
391 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  27.98 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  20.35 
 
 
481 aa  43.5  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2103  major facilitator transporter  31.62 
 
 
449 aa  43.5  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.552492  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  20.05 
 
 
444 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  36.07 
 
 
441 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  20.05 
 
 
444 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  25.29 
 
 
436 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 
415 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  27.38 
 
 
422 aa  42.7  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>