45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07155 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  849    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 433 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  31.18 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 448 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  29.69 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 440 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 419 aa  167  5e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  29.78 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 425 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  27.67 
 
 		 425 aa  127  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  26.93 
 
 		 425 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 425 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 425 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  26.93 
 
 		 425 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  27.67 
 
 		 425 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  27.49 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  27.49 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  27.38 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 421 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  27.25 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 421 aa  99.8  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  25 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  21.63 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  23.81 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  25.47 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  23.81 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  36.36 
 
 		 103 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1684  hypothetical protein  37.18 
 
 		 90 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  25.7 
 
 		 455 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  25.7 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1683  hypothetical protein  33.9 
 
 		 82 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  24.52 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  24.57 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0838  hypothetical protein  26.17 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.0062417  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>