57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2463 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  78.42 
 
 		 425 aa  669    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  78.42 
 
 		 425 aa  669    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  78.9 
 
 		 425 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  100 
 
 		 427 aa  860    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  78.9 
 
 		 425 aa  673    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  78.9 
 
 		 425 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  78.42 
 
 		 425 aa  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  78.9 
 
 		 425 aa  673    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  78.42 
 
 		 425 aa  670    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  31.12 
 
 		 428 aa  216  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  30.35 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  28.57 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  28.57 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  28.57 
 
 		 421 aa  163  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 421 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 448 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  27.29 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  31 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 440 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  26.58 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 214 aa  103  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  23.92 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 207 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  22.28 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  30.49 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  20.62 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  25.24 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  34.62 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  24.91 
 
 		 497 aa  44.7  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6462  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320121  hitchhiker  0.0000481514 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  34.95 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  34.95 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  34.95 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  34.95 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  34.95 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  34.95 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  34.95 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1684  hypothetical protein  28.57 
 
 		 90 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  23.06 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>