33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3509 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  100 
 
 		 214 aa  428  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 		 421 aa  171  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  41.95 
 
 		 421 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 421 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 421 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 421 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  41.95 
 
 		 421 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 421 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  40.98 
 
 		 421 aa  167  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  42.05 
 
 		 428 aa  157  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 421 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 419 aa  134  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  33.66 
 
 		 422 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  30.65 
 
 		 425 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  30.65 
 
 		 425 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  30.65 
 
 		 425 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  30.15 
 
 		 425 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  30.15 
 
 		 425 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  30.15 
 
 		 425 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 425 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 425 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 427 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 440 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 433 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 448 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  27.86 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  25 
 
 		 428 aa  75.1  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  27.43 
 
 		 461 aa  72.8  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1683  hypothetical protein  30.86 
 
 		 82 aa  48.5  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  21 
 
 		 427 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 422 aa  42  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>