45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0068 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 419 aa  833    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  47.46 
 
 		 428 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  40.57 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  37.99 
 
 		 421 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  37.99 
 
 		 421 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 421 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 421 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 421 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  37.99 
 
 		 421 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 		 421 aa  266  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 421 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  32.6 
 
 		 425 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  32.6 
 
 		 425 aa  229  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  32.12 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  32.36 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  32.45 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  32.45 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 427 aa  226  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  35.75 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 448 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 423 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  32.33 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  29.8 
 
 		 427 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 207 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 214 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  23.81 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  22.44 
 
 		 497 aa  75.9  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  22.08 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  38.82 
 
 		 103 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1684  hypothetical protein  46.38 
 
 		 90 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1682  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1683  hypothetical protein  36.36 
 
 		 82 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  21.72 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 437 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 417 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>