224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0523 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  813    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  56.8 
 
 		 421 aa  434  1e-120  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 		 415 aa  312  5.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 401 aa  285  8e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  33.8 
 
 		 442 aa  225  9e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4675  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  24.16 
 
 		 450 aa  89  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  23.91 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  28.99 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  26.83 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3289  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 531 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 531 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  22.72 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 530 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  22.61 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  30.77 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  28.63 
 
 		 529 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  24.02 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0654  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0842351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 551 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 551 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 551 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 551 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 518 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 519 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1831  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.612991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 551 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  23.69 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  24.24 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  29.8 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  22.98 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0999  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0123393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  22.71 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  21.21 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  23.84 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  21.84 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  30.77 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  25.9 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 510 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  30.32 
 
 		 445 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  25.25 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  32.32 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  21.05 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.52 
 
 		 476 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  40 
 
 		 468 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  30 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  21.03 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  39.51 
 
 		 479 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  30.3 
 
 		 433 aa  53.9  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 389 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 396 aa  53.5  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1691  hypothetical protein  26.75 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  33.33 
 
 		 465 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  34.91 
 
 		 544 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  31.4 
 
 		 461 aa  53.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  20.98 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.43 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  32.35 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  31.01 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  22.88 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  31.48 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.19 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.86 
 
 		 457 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>