75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0975 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  996    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  70.48 
 
 		 493 aa  701    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 551 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 		 551 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 551 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 531 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 531 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  38.48 
 
 		 529 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  40.04 
 
 		 518 aa  362  9e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  37.52 
 
 		 501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 524 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  36.5 
 
 		 507 aa  347  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 505 aa  346  5e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  39 
 
 		 448 aa  343  5.999999999999999e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 502 aa  335  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 495 aa  322  9.000000000000001e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 502 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 501 aa  302  9e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 449 aa  294  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  36.46 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  37.71 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 509 aa  290  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  37.27 
 
 		 453 aa  289  8e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 457 aa  286  5e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  32.25 
 
 		 471 aa  276  6e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  33.2 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  33.33 
 
 		 453 aa  265  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 551 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  49.58 
 
 		 519 aa  246  9e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  50.85 
 
 		 530 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 461 aa  243  5e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  33.33 
 
 		 428 aa  223  9e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 458 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  33.72 
 
 		 443 aa  216  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 514 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  45.3 
 
 		 510 aa  207  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 500 aa  192  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  25.25 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  22.15 
 
 		 674 aa  61.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  21.02 
 
 		 635 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 401 aa  54.3  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.77 
 
 		 465 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  25.82 
 
 		 469 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.76 
 
 		 471 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  34.02 
 
 		 479 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 415 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  24.77 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0883  alpha-ketoglutarate transporter  31.88 
 
 		 431 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.103256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 461 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  32.33 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  26.5 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  24.71 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  24.71 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  24.71 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 460 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24700  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3496  alpha-ketoglutarate transporter  26.5 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 438 aa  44.3  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  25.34 
 
 		 428 aa  43.9  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>