76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2003 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  76.08 
 
 		 519 aa  798    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  74.81 
 
 		 551 aa  784    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  69.85 
 
 		 524 aa  742    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  74.81 
 
 		 551 aa  785    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  66.79 
 
 		 518 aa  712    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  75 
 
 		 551 aa  787    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  72.61 
 
 		 531 aa  775    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  68.56 
 
 		 551 aa  735    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  72.66 
 
 		 531 aa  775    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  72.66 
 
 		 531 aa  774    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  100 
 
 		 530 aa  1071    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  72.35 
 
 		 529 aa  778    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  75 
 
 		 551 aa  787    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  58.93 
 
 		 502 aa  598  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  58.41 
 
 		 501 aa  581  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  55.3 
 
 		 505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  54.81 
 
 		 507 aa  568  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  60.12 
 
 		 495 aa  565  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  52.2 
 
 		 502 aa  528  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  52.71 
 
 		 510 aa  519  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  56.76 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  60.85 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  54.46 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  58.6 
 
 		 441 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  50.85 
 
 		 498 aa  244  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  51.82 
 
 		 493 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  50.55 
 
 		 428 aa  183  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  43.18 
 
 		 450 aa  182  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  43.18 
 
 		 450 aa  179  8e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 458 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  36.44 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  38.77 
 
 		 453 aa  174  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 457 aa  173  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  37.55 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  36.05 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  37.66 
 
 		 443 aa  161  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  37.34 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  25.93 
 
 		 635 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  30.46 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  27.91 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 435 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 415 aa  54.3  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.06 
 
 		 472 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 401 aa  51.2  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  28.81 
 
 		 416 aa  51.2  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 472 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 464 aa  50.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 486 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  25.81 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 404 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  24.26 
 
 		 411 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 		 674 aa  47.4  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 426 aa  47.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  29.75 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 503 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  23.67 
 
 		 411 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  41.82 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  25.88 
 
 		 408 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  55.88 
 
 		 511 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>