272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0454 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 404 aa  784    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  61.98 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 438 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  32.22 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  28.42 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  26.69 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 443 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  28.89 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  24.73 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.66 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  25.61 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  24.64 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  24.25 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  26.26 
 
 		 427 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 551 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 551 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  24.92 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 551 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  26.26 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 551 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  28.8 
 
 		 583 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2321  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 582 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 519 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  22.58 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  24.23 
 
 		 545 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  25.57 
 
 		 483 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  23.56 
 
 		 450 aa  53.9  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  30.97 
 
 		 529 aa  53.5  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 531 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 531 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 417 aa  53.1  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  26.23 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  25.68 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0193  major facilitator family transporter  23.69 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0131  general substrate transporter  25.77 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482205  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  22.25 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 551 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  25.08 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 554 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  28.3 
 
 		 507 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  25.08 
 
 		 485 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 502 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 448 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 505 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 524 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  24.75 
 
 		 485 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  24.75 
 
 		 485 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  24.75 
 
 		 485 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  24.75 
 
 		 485 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  25.33 
 
 		 485 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  32.63 
 
 		 501 aa  50.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1700  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  24.75 
 
 		 485 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 554 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 397 aa  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>