77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3554 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  100 
 
 		 423 aa  834    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 425 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  37.83 
 
 		 423 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 425 aa  212  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  31.48 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 443 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  31.59 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 404 aa  117  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  29.84 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  28.62 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  25.14 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  27.78 
 
 		 210 aa  72.4  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  26.81 
 
 		 545 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  26.51 
 
 		 583 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  28.49 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 457 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 443 aa  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  27.21 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 518 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 530 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  29.41 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  26.11 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  36 
 
 		 501 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  33.68 
 
 		 507 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  31.03 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1889  major facilitator family transporter  22.72 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000253585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 480 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 551 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 551 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 551 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 551 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  31.63 
 
 		 469 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  27.43 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 488 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 439 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  32.04 
 
 		 492 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  29.32 
 
 		 489 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 482 aa  43.1  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  53.12 
 
 		 460 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>